Счетоводството на дружество с нестопанска цел се различава от счетоводството на обикновено предприятие. Основната разлика е, че организацията с нестопанска цел няма собственици, така че всички излишни средства трябва да се използват за постигане на целите на организацията, вместо да се разпределят между акционерите. Това означава, че организацията с нестопанска цел трябва внимателно да проследява приходите и разходите си, за да гарантира, че използва ресурсите си по възможно най-ефективния начин. Счетоводната отчетност на организациите с нестопанска цел може да бъде сложна, но тя е от съществено значение за гарантиране, че организацията е в състояние да постигне своите цели.