Счетоводството на електронния магазин е процесът на регистриране, категоризиране и обобщаване на финансовите транзакции на онлайн магазина. Това включва продажби, възстановявания, комисиони, такси и други приходи, както и разходи като доставка, реклама и хостинг на уебсайта. Счетоводното отчитане на електронен магазин може да бъде сложна и трудоемка задача, но е от съществено значение за управлението на успешен бизнес. Правилното счетоводство помага на собствениците на бизнес да проследяват приходите и разходите си, да разбират финансовото си състояние и да вземат информирани решения за това как да развиват бизнеса си. Съществуват много софтуерни програми, които помагат при счетоводството на електронния магазин, а много счетоводители са специализирани в тази област. За фирмите, които нямат време или ресурси да се справят сами със счетоводството, възлагането на тази задача на професионалист може да бъде разумно решение.